פרויקט סיום בקורס אנליזה ממוחשבת של חומצות גרעין
| מוסד לימוד | האוניברסיטה העברית, ירושלים |
| מקצוע | ביולוגיה |
| מילות מפתח | אנליזה, ביואינפורמטיקה |
| שנת הגשה | 2006 |
| מספר מילים | 5747 |
תקציר העבודה
תרגיל סיום קורס 73548
נעשתה הגברה של שישה פרגמנטים של נגיף, r1, 2, 3, 4, 5 and 6 שבודד מתאים.
צרו בצורה ממוחשבת את גנום הנגיף השלם וזהו אותו.
בנוסף לכך זהו את מקור התאים מהם בודד הנגיף ששימש להגברה.
הניחו הנחה הגיונית האם ניתן יהיה לגדל מחדש את הנגיף שהתקבל.
במידה וההנחה הנה שלילית צרו גנום אשר יהיה מסוגל לתמוך ברפליקציה של הנגיף.
הוכיחו שגנום שהתקבל הוא אכן גנום שניתן להשתמש בו לקבלת נגיף אשר מסוגל להתרבות (הוכיחו זאת בלפחות שתי דרכים שונות שאחת מהם איננה כרוכה בריצוף). לאחר יצירת הגנום השלם שבטו את הרצף המלא לפלסמיד (+) pBluescript II KS. השתמשו בפלסמיד החדש שהתקבל ליצירתו של נגיף שלם ומדביק בתרבית תאים בשימוש ב RNA נגיפי רקומביננטי הדומה למבנה הטבעי שלו. התאים הנתונים שבהם אמור הנגיף להתרבות מבטאים מספר גנים נגיפיים, זהו את החלבונים הללו. התשובות חייבות לכלול הסבר מלא ומנומק של כל אחד מהשלבים שבוצעו.
בהצלחה
