דוח מעבדה מס' 2 – בקטריופאג'ים מטרת המעבדה ביצוע מעקב אחר עכירות תרבית של חיידקי E.coli המודבקת ע"י פאג' T4 וקביעת סדר גודל של ה- Burst Size.
מבוא
בקטריופאג' (פאג') הוא נגיף שתוקף חיידקים. הפאג' בנוי ממולקולה של חומצת גרעין (DNA או RNA) אשר עטופה במעטפת חלבונית וזנב אשר נצמד לשטח פני החיידק וחומצת הגרעין מוחדרת אל תוך החיידק. הפאג' גדל ומתרבה בתא החיידק, שבסופו של דבר נהרס ומשחרר פאג'ים חדשים. פאג'ים פתגונים (גורמי מחלות) משתמשים במנגנוני השעתוק והתרגום של החיידק ליצירת פאג'ים חדשים (הכוללים גם מעטפת) בתוך תא החיידק .
הפאג'ים החדשים משמידים את תא החיידק, מתרחש ליזיס (המסה) והפאג'ים החדשים שנוצרו משתחררים אל הסביבה ומדביקים חיידקים אחרים. כתוצאה מהליזיס עכירות התרבית של החיידקים יורדת וכך ניתן לעקוב אחר התרבות הפאג'ים. סדר הגודל של מס' הבקטריופאג'ים הממוצע הנוצרים בחיידק מודבק נקרא Burst Size והוא מחושב מהיחס של מספר המוקדים בשלב הרגיעה למספר המוקדים בתקופה הלטנטית. הסמן לנוכחות פאג'ים בצלחת של מושבות החיידקים הוא נוכחות של פלאקים – חורים שקופים הנוצרים כתוצאה מפעילות הפאג'ים. אלו הם בעצם מוקדים בהם תיראה ההמסה של החיידקים ע"י הפאג'ים על רקע מושבות החיידקים. מקורו של כל מוקד בחיידק מודבק אחד או בפאג' חופשי אחד שהשתחרר למצע. תהליך הדבקת החיידקים ע"י הפאג' שנקרא המסלול הליטי מורכב מ- 3 שלבים: תקופת החביון, שלב שנמשך כ- 20 דקות ב- E.coli ובו לא חל שינוי במספר הפלאקים. שלב עלייה, בו יש עלייה מהירה במספר הפלאקים ובמהלכו מומסים יותר ויותר חיידקים. תקופת הרגיעה, שלב בו אין שינוי במספר המוקדים. המעבר מתקופת העלייה לתקופת הרגיעה מתרחש כאשר כל החיידקים שבהם התרבו פאג'ים הומסו ולכן לא משתחררים פאג'ים חדשים.