שאלה 1 א. השתמשו בסימולציה על מנת לענות על השאלה הבאה: ביחסי דומיננטיות מלאה: מי מתקבע לתדירות 1 במהירות רבה יותר בתנאי סלקציה – אלל רצסיבי
נפוץ או אלל דומיננטי נפוץ? תארו את תוצאותיכם וצרפו את התרשימים הרלוונטיים מסימולציית AlleleA1 . ב. ציינו אילו סוגי סלקציה, שלמדתם במהלך יחידה 5, גורמים להקטנת פולימורפיזם באוכלוסייה. הסבירו את תשובתכם. ג. עבור כל סוג של סלקציה שהסברתם בתשובתכם בסעיף הקודם (סעיף ב') הדגימו, בעזרת דוגמה שאינה מוזכרת בסרטונים ו/או במדריך הלמידה. שאלה 2 . חזרו ליחידה 2, לסעיף 2.4 (בעמודים 23-16 ),קראו את המקרה לדוגמה "אבולוציה של וירוס ה- HIV וענו על סעיפים א–ח שלהלן. פתחו את סימולציית AlleleA1 והגדירו את האלל העמיד 32Δ-CCR5 כאלל A1 (ואת האלל +, שאינו מעניק עמידות ל- HIV , כאלל A2 ).הזינו בתוכנה 50 עבור מספר הדורות (מכיוון שאורך דור של אדם הוא כ- 25 שנים, 50 דורות נמשכים בקירוב כ- 1,250 שנים). בעזרת הסימולציה צרו ארבעה תרחישים אבולוציוניים אפשריים:
א. תרחיש ראשון: הזינו 0.3 עבור התדירות ההתחלתית של האלל A1 (האלל 32Δ-CCR5 ),והזינו את ערכי המותאמות של שלושת הגנוטיפים באופן הבא:
עבור גנוטיפ A1A1 (Δ 32 / Δ32 ) : 1 . עבור גנוטיפ 0.7: A1A2 ( Δ32 / +) . עבור גנוטיפ A2A2 (+ / +): 0.7. הריצו את הסימולציה. צרפו את התרשים שהתקבל.
ב. תרחיש שני: הזינו 0.01 עבור התדירות ההתחלתית של האלל 1A (האלל 32Δ-CCR5 ), והזינו את ערכי המותאמות של שלושת הגנוטיפים באופן הבא:
עבור גנוטיפ A1A1( 32Δ / 32Δ ): 1 . עבור גנוטיפ A1A2 ( 32Δ/ + ) : 0.7. עבור גנוטיפ A2A2 (+ / +): 0.7. הריצו את הסימולציה. צרפו את התרשים שהתקבל.
ג. תרחיש שלישי: הזינו 0.3 עבור התדירות ההתחלתית של האלל 1A (האלל 32Δ-CCR5 ),והזינו את ערכי המותאמות של שלושת הגנוטיפים באופן הבא:
עבור גנוטיפ A1A1( 32Δ / 32Δ ): 1. עבור גנוטיפ A1A2 ( 32Δ /+ ): 0.995. עבור גנוטיפ A2A2 (+ / +): 0.995 .הריצו את הסימולציה. צרפו את התרשים שהתקבל.
ד. תרחיש רביעי: הזינו 0.01 עבור התדירות ההתחלתית של האלל 1A(האלל 32Δ-CCR5 ), והזינו את ערכי המותאמות של שלושת הגנוטיפים באופן הבא:
עבור גנוטיפ A1A1 ( 32Δ /32Δ) : 1. עבור גנוטיפ A1A2( 32Δ/+) :0.995. עבור גנוטיפ A2A2 (+ / +): 0.995 .הריצו את הסימולציה. צרפו את התרשים שהתקבל.
ה. תארו את התוצאות שקיבלתם בארבעת התרחישים האבולוציוניים (סעיפים א-ד) והסבירו את ההבדלים ביניהם.
שאלה 3 . על סמך הממצאים שקיבלתם בשאלה הקודמת (שאלה 2 ), ענו על הסעיפים הבאים: א. האם אתם יכולים לשייך שני תרחישים (מתוך ארבעת התרחישים האבולוציוניים המתוארים בשאלה 2) למגפות שלמדנו עליהן ביחידה 2 , סעיף 2.4.1 (עמוד 16) ? ב. האם לדעתכם מגפת האיידס תגרום במהלך הזמן לעלייה בתדירות של האלל CCR5-Δ32 ,
אשר עמיד ל- HIV , ולהתפשטותו באוכלוסייה האנושית? הסבירו את תשובתכם על סמך הממצאים שקיבלתם בשאלה הקודמת (שאלה 2 ). ג. מה אפשר לעשות, באופן היפותטי, על מנת שמגפת האיידס אכן תגרום במהלך הזמן לעלייה בתדירות של האלל CCR5-Δ32 ולהתפשטותו באוכלוסייה האנושית?