תרגיל מסכם בביואינפרמטיקה - כל המידע הביואינפורמטי עבור החלבון ⥍
מוסד לימוד | המכללה האקדמית תל-חי |
סוג העבודה | עבודה אקדמית |
מקצוע | מדעים |
מילות מפתח | ביואינפורמטיקה, ביוטכנולוגיה, תגובה חיסונית |
שנת הגשה | 2010 |
מספר מילים | 5053 |
מספר מקורות | 15 |
תקציר העבודה
תקציר:
מערכת המשלים זהו מסלול ביוכימי, המשחק תפקיד חשוב בתגובה החיסונית המולדת והנרכשת.
התפקידים העיקריים של המערכת הם : ליזיס של מיקרואורגניזמים,סיוע בתהליך הפגוציטוזה של הפטוגן והתפתחות התגובה הדלקתית. מערכת המשלים מורכבת מ20 חלבונים, הנמצאים בנסיוב בצורה בלתי פעילה. בנוסף כוללת המערכת פקטורים Bו D וחלבונים נוספים, בעלי פעילות רגולתטורית על המערכת.
הפעלתה של מערכת המשלים יכולה להיעשות באמצעות שלושה מסלולים: המסלול הקלאסי, מסלול הלקטין קושר המאנוזה: Mannose-Binding Lectin והמסלול האלטרנטיבי. שלושת המסלולים מובילים אל מסלול משותף שמטרתו להביא לסילוקם של האנטיגנים הזרים והרג של החיידקים בגוף. כל המסלולים נפגשים בפירוק של המרכיב 3C שלו התפקיד המרכזי במערכת.
· במהלך עבודה זו,נוכחתי לראות שהחלבון С3, הינו נחקר רבות וישנו מידע ביואינפרמטי רב עבורו. חשיבותו רבה בתגובה החיסונית הלא ספציפית.
· הגן C3 ממוקם על גבי כרומוזום מס' 19 המקודד ע"י 41 אקסונים. חוץ מאיזורים קצרים באקסונים 1 ו 41
,כל האקסונים מקודדים.
· החלבון C3 מכיל בתוכו רצפים שמורים, אשר נמצאו כמעט בכל הממלכות (למעט פרוקריוטה). עובדה זו מצביעה על חשיבותו בתפקודה התקינה של מערכת החיסון.
· קיימת רמה גבוהה של הומולוגיה לחלבון זה בבעלי חיים רבים ,דבר היכול להעיד שמדובר בחלבון יחסית קדום.
· לגן זה קיים מס' גדול של SNP's אשר ניתן לעשות להם אמפליפיקציה ב- PCR ולאפיין את האלל בעזרת אנזים רסטריקציה ספציפי.
המבנה השניוני של החלבון מאופיין ברובו בלופים (כ- 47%) ומיעוטו בבטא-שיט (כ- 36%) ואלפא-הליקס (כ- 16%).